Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmQ64674 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmQ64674 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmQ64674 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SrmQ64674 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SrmQ64674 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmQ64674 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmQ64674 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmQ64674 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmQ64674 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrmQ64674 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmQ64674 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SrmQ64674 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms