Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ca4Q64444 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms