Protein–RNA interactions for Protein: Q64302

Tm4sf1, Transmembrane 4 L6 family member 1, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf1Q64302 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm4sf1Q64302 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tm4sf1Q64302 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms