Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh2Q64221 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms