Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccdc18Q640L5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc18Q640L5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
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