Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup62Q63850 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms