Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa13Q62424 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa13Q62424 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms