Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Kdm5dQ62240 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Kdm5dQ62240 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Kdm5dQ62240 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms