Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgfb1i1Q62219 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb1i1Q62219 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms