Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Ttf1Q62187 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
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Ttf1Q62187 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf1Q62187 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Ttf1Q62187 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Ttf1Q62187 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttf1Q62187 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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