Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SspnQ62147 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SspnQ62147 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SspnQ62147 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SspnQ62147 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SspnQ62147 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SspnQ62147 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SspnQ62147 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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