Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sin3bQ62141 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sin3bQ62141 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms