Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms