Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2aQ62066 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2aQ62066 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2aQ62066 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2aQ62066 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2aQ62066 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2aQ62066 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2aQ62066 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2aQ62066 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phox2aQ62066 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2aQ62066 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2aQ62066 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2aQ62066 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2aQ62066 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2aQ62066 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2aQ62066 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2aQ62066 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2aQ62066 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phox2aQ62066 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms