Protein–RNA interactions for Protein: Q61718

Ifna15, Alpha-interferon, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna15Q61718 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna15Q61718 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna15Q61718 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna15Q61718 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna15Q61718 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna15Q61718 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna15Q61718 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna15Q61718 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna15Q61718 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna15Q61718 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna15Q61718 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna15Q61718 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna15Q61718 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna15Q61718 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna15Q61718 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna15Q61718 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna15Q61718 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 663.6 ms