Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli3Q61602 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gli3Q61602 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms