Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vsx2Q61412 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms