Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamb3Q61087 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamb3Q61087 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms