Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrkQ60976 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrkQ60976 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrkQ60976 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrkQ60976 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrkQ60976 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrkQ60976 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrkQ60976 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrkQ60976 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrkQ60976 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrkQ60976 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
JrkQ60976 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JrkQ60976 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrkQ60976 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JrkQ60976 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms