Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp7Q60973 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp7Q60973 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms