Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Neurod1Q60867 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Neurod1Q60867 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms