Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk2a1Q60737 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk2a1Q60737 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms