Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samhd1Q60710 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samhd1Q60710 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms