Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SkiQ60698 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SkiQ60698 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SkiQ60698 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkiQ60698 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkiQ60698 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkiQ60698 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkiQ60698 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkiQ60698 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkiQ60698 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkiQ60698 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkiQ60698 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkiQ60698 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms