Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Prdm1Q60636 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms