Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr2f1Q60632 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms