Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc1Q60596 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Xrcc1Q60596 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Xrcc1Q60596 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc1Q60596 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc1Q60596 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc1Q60596 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc1Q60596 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc1Q60596 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc1Q60596 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc1Q60596 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc1Q60596 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xrcc1Q60596 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms