Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema5bQ60519 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms