Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd5Q5VCS6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms