Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Specc1Q5SXY1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Specc1Q5SXY1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms