Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Vmn1r195Q5SVD6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Vmn1r195Q5SVD6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vmn1r195Q5SVD6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vmn1r195Q5SVD6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Vmn1r195Q5SVD6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Vmn1r195Q5SVD6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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