Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv4Q5R1A3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms