Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN45

UPF0691 protein C9orf116 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5BN45 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5BN45 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5BN45 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5BN45 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5BN45 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5BN45 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5BN45 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5BN45 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5BN45 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5BN45 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5BN45 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5BN45 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5BN45 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5BN45 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5BN45 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5BN45 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5BN45 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5BN45 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5BN45 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5BN45 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5BN45 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5BN45 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q5BN45 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q5BN45 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q5BN45 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q5BN45 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q5BN45 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q5BN45 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q5BN45 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q5BN45 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q5BN45 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q5BN45 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q5BN45 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q5BN45 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms