Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spire1Q52KF3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms