Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1qtnf9Q4ZJN1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1qtnf9Q4ZJN1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms