Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Krtap1-4Q3V2D6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms