Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmub2Q3V209 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms