Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms