Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hipk4Q3V016 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hipk4Q3V016 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms