Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms