Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn13Q3UW68 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms