Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pate2Q3UW31 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate2Q3UW31 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate2Q3UW31 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate2Q3UW31 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate2Q3UW31 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate2Q3UW31 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate2Q3UW31 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate2Q3UW31 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate2Q3UW31 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate2Q3UW31 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate2Q3UW31 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate2Q3UW31 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate2Q3UW31 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate2Q3UW31 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate2Q3UW31 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate2Q3UW31 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate2Q3UW31 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pate2Q3UW31 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms