Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nr1d1Q3UV55 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nr1d1Q3UV55 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nr1d1Q3UV55 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nr1d1Q3UV55 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nr1d1Q3UV55 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr1d1Q3UV55 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr1d1Q3UV55 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr1d1Q3UV55 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr1d1Q3UV55 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr1d1Q3UV55 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr1d1Q3UV55 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr1d1Q3UV55 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr1d1Q3UV55 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms