Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prom2Q3UUY6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prom2Q3UUY6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms