Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap1Q3UUV5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap1Q3UUV5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap1Q3UUV5 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap1Q3UUV5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap1Q3UUV5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap1Q3UUV5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap1Q3UUV5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap1Q3UUV5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Skap1Q3UUV5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skap1Q3UUV5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skap1Q3UUV5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Skap1Q3UUV5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skap1Q3UUV5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skap1Q3UUV5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skap1Q3UUV5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms