Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Thsd4Q3UTY6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Thsd4Q3UTY6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms