Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Obox3Q3UT54 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox3Q3UT54 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms