Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BB287469Q3UT53 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms