Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rtl4Q3URY0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl4Q3URY0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms