Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc4Q3UP44 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms